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2、因素分析法是将有关的财务指标与影响财务状况的各种因素有序地组合在一起，综合分析学校财务状况和财务成果的分析方法。财务分析一定要深刻领会财务数据背后的业务背景，切实揭示业务过程中存在的问题。财务人员在做财务分析时，不是财务数据上的简单拼凑和加工，每一个财务数据背后都寓示着非常生动的金额增减、费用发生、负债偿还等。财务人员通过对业务的了解和明察，并具备对财务数据敏感性的职业判断，同时不应参考财务管理、金额、法律、市场信息及有关资料，使财务分析资料更加真实、完整。来剖析学校当前财务状况和财务成果产生的原因，为领导者作出决策和控制提供有力依据。
除上述两种方法外，还应根据实际情况，适当选用动态分析法、综合分析法、专题分析法等，把几种财务分析方法相互结合在一起综合运用，将财务活动的各项指标与其相关的因素相互联系进行综合分析与研究，克服片面性，形成对财务活动与财务状况全面的认识和了解，这样更有利于清晰地反映数据的变化情况;在财务活动分析中，还要注重全面分析与重点分析的结合，在对学校全部经济活动进行整体分析研究时，还要对那些影响学校财务活动的主要方面，进行重点分析，有的放矢，从而抓住主要矛盾和关键问题，以便制定有效措施。
(四)做好财务分析必须建立科学的分析体系
财务分析是在财务报表的基础上，根据不同层次的需要，做出若干方面的分析。一般有决算分析、阶段性分析和专项分析等。要做好以上各项分析，首先要建立一套完整的、科学的财务分析体系。它包括分析的内容。如：效益的分析;偿债能力的分析;收支结构的分析;发展能力的分析等。笔者认为高校的财务分析应建立以下几个方面的财务分析指标体系：
1、预算执行情况。包括实际收入、实际支出与预算(计划)差异，收入预算完成率、支出预算完成率，利用这些指标分析预算收支的实际完成情况、实际与预算产生的差异以及原因。
2、收入、支出情况。包括年末总收入与总支出之比、人员支出、公用支出占事业支出的比重、生均事业支出、教职工人均事业支出、现金流入流出比等，利用这些指标分析收入、支出构成和变化情况及原因，分析单位组织收入的能力、支出结构合理性等。
3、资产使用情况。包括各类资产比重、设备利用率、投资收益率、生均教学仪器设备、生均校舍面积、生均图书资料等，分析单位的资产构成的合理性和资产的利用情况，考核是否合理配置资源，发挥资金使用效益。
4、偿债能力。包括流动比率、资产负债率、现金负债比率、现金流动负债比率、现金到期负债比率，通过这些指标来分析负债水平是否符合有关规定、负债水平是否合理、负债构成和负债规模是否适度以及负债风险承受能力等。
5、趋势分析及发展能力。包括近几年各类资产增长率、收入增长率、支出增长率、生均事业支出增长率等，根据发展情况进行趋势分析，预测发展前景。
财务分析指标的设置应具有科学性、可比性、可行性，符合单位特性。当上述指标不能完全准确地反映经营成果和面临的财务风险时，财务人员应选用、设计能反映本单位财务状况和实际的指标体系，以客观反映财务的真实状况。另外还要注重分析指标的综合运用，将定量指标与定性指标、横向指标与纵向指标、静态指标与动态指标相结合，进行综合分析，发挥财务分析的总体功能效应。