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目前，我国会计师事务所的组织形式大多数是有限责任公司，注册会计师主要通过薪金的形式取得报酬，这部分利益所得相对于出资人而言可谓太少。但是，作为在审计报告上签字的注册会计师而言，所要承担的风险和责任又可谓太重。也就是说，当前利益分配制度中的主要缺陷是注册会计师承担的风险与得到的报酬极不相称，这会在很大程度上挫伤注册会计师的工作积极性。因此应该注意公平对待各类各级员工，注意处理好管理层与员工间的利益分配关系，合理制定各级工资奖酬间的级差倍数。
同时，在有限责任公司制的会计师事务所里，注册会计师通常认为自己是在给出资人打工，很难建立起主人翁意识，这会造成会计师事务所缺乏凝聚力、难以实施长远规划的局面。针对这种现象，可以借鉴其他实体性质公司的作法即实施员工持股计划。目前，我国的部分会计师事务所对此有所尝试，但是由于如果給予员工的持股比例太低就会达不到预期的效果，而如果給予员工的持股比例太高又害怕损害到出资人的利益，所以真正实施起来的时候大多束手束脚。本文建议把持股计划设计为持续累积持股的形式，结合注册会计师的工作业绩和执业年限，配合持股方案，逐步将业绩突出的核心注册会计师提升为中层负责人甚至吸收为出资人，以激励注册会计师以主人的身份而非被雇佣者的身份积极为会计师事务所的 发展 尽力献策，这样才能使我国会计师事务所的核心竞争力得到最大程度的提升。
(三)拥有整合核心资源的优秀主体——企业家才能
火车跑得快，全靠车头带。无论是要拥有核心资源，还是要利用有效的制度整合核心资源，都需要具有企业家才能的主任会计师来操作，否则一切都是空谈。
目前，我国的会计师事务所在管理体制和制度上差别很大，尚未形成比较系统、合理、成熟的管理平台，因此，主任会计师的管理理念和思想对会计师事务所的发展状况起着非常重要的作用。主任会计师对事务所的执业结果要承担 法律 责任;对事务所的发展前途承担管理责任;对事务所的经营理念和执业人员的执业理念承担引导责任;对事务所在 社会 中的诚信水平及职工利益都要承担相应责任。没有一个具备成功潜质的主任会计师的会计师事务所，要形成自己的核心能力、创造自己的竞争优势，要拓展业务、控制业务风险，要平衡事务所内部利益，要扩大规模、上水平上质量，都是不可能的。因此，主任会计师不仅要有较高的执业水平，还应具备较强的市场开拓能力;不仅是事务所的科学管理者，还要是各方面关系的协调者，要敢于吃苦，善于沟通，有较好的凝聚力。
目前我国主任会计师的素质参差不齐，远不能适应事务所发展的需要。要提升我国会计师事务所的核心竞争力，就必须打造一批素质过硬的主任会计师做领头羊。一方面要提高主任会计师受 教育 的程度，例如在申请设立会计师事务所时将受教育程度作为门槛条件;另一方面要大力培训其管理方法和技能，这主要依靠注册会计师协会组织后续教育、提供国内各所之间或者与国际所之间进行交流提高的机会。