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其次是，中国烟草企业在信息化方面的投入累计不下100亿元，整体行业信息化建设水平较高，但这种高水平的建设并没有形成高水平的应用。企业建立了完整的MIS系统，ERP系统、或者是CRM系统，但大多数都是量身定做，即根据各业务部门的需求，用计算机来模拟以前的手工业务，把系统功能模块化，而不是真正管理数字的集成系统。
第三，信息化项目的反复投建，而忽略信息系统的整合和升级。以OA系统为例，大约有50%的企业在2004年之前建设和应用了OA系统，但在国家的系统规划中，OA系统成为一个反复建设的内容。
第四，在行业信息系统建设的组织实施中，缺少一个专门技术总监来对此进行总体把关和协调，建设的系统没有整体思路。目前所有项目的实施都是靠国家机关的管理体制和组织行为来指挥和控制系统的实施与开发。这样就使得开发过程中合理建议难以提出，提出后难以被采纳，采纳后又难以得到有效执行。各子系统分散开发，各自为政，没有完全按照总承要求去做。遇到标准问题许多子系统都是按照自己制定的“标准”进行开发，没有使用国家标准或相应的行业标准。给今后的集成带来了极大困难。
综上所述，当前烟草行业还是一个具有一半计划一半市场的行业，利用信息化强化管理是一个理想状态，因此存在问题也不可避免，关键在于如何解决这些问题所产生的不良影响。从当前烟草行业的趋势分析，集中和统一势在必行，但在实施和执行的过程中，如何协调各方的利益，保证信息系统的有效，才是中国烟草行业信息化的核心。
建设CIMS系统
针对烟草行业信息化建设现状与问题，按照烟草战略发展的基本思路和当前改革与发展的要求，组织制定烟草行业信息化建设CIMS的发展战略和总体规划，必须利用CIMS的先进思想和方法，努力实现行业大集成。
充分利用行业现有的统一领导、垂直管理、专营专卖这种特有的有利于集成和统一的有利条件和现有的组织保证，将烟草行业包括烟叶生产、收购、复烤，卷机制造、卷烟生产、辅料生产和卷烟销售等业务所形成的行业完整的供应链，建成一个统一或相对统一的集成系统。
将现代化管理技术和先进理念与烟草行业具体管理业务相结合，逐步实现卷烟企业现代集约化管理、实现网上交易与现代物流配送、电子政务管理等部分业务的集成应用和信息资源共享，最终实现烟草行业信息应用系统的大集成。推动和支撑烟草行业的改革与发展，建立起我国烟草行业的“大市场”、“大企业”、“大品牌”、“大联合”，全面提高我国烟草行业的整体凝聚力和国际竞争力。
总体上，以卷烟产品的设计、生产、销售与市场监管为主线，坚持“实用性、先进性、安全性、开放性、完整性”的指导原则，烟草行业CIMS需要解决烟草行业监管系统、现代营销系统、卷烟企业CIMS三大系统建设与应用集成，实现彼此信息交换与业务过程集成。
总之，在行业CIMS具体建设过程中，要坚持“统筹规划、分步实施、逐级集成”的原则，最终实现烟草行业整体经济快速发展。