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应该将供应链的战略目标作为企业组织机构调整的出发点，根据供应链的战略目标来进行组织重构。这一阶段要完成以下工作：职能机构的改造、人员的重新分配、管理制度的健全、绩效的评价和考核、企业协调文化的培育等。这些工作是相辅相成的，机构建立后需要人员和制度来管理，每个人员又都是处在一定的机构层次上，人员配置好后要考核他们的工作绩效以期进行改善，一个协同组织必然存在企业协同文化，这种文化要适应供应链管理的需要。一般而言，供应链间的虚拟组织构建需要注意以下几个方面：各节点企业职能机构向扁平化、网络化发展，分权和缔造学习型组织。
4.2 流程重构。
传统企业流程存在的各企业质量标准不统一、生产能力不一致、物流路线设计不合理以及信息不对称等问题阻碍了供应链的协同管理。流程重构就是要改变那些不合理的企业流程，以适应供应链协同管理的需要，从而提高供应链管理的绩效和顾客满意度，降低供应链的整体运营成本。
流程重构主要从以下几个方面着手：首先是消除非增值活动，站在供应链的整体高度来审视各企业间流程，通过协调各企业，对流程路线进行改进甚至重新设计，减少流程中的库存、运输转移、返回、检测等活动。例如，利用JIT的思想设计流程，可大幅度减少非增值活动。其次，进行工作整合，实际上流程中许多工作是可以整合的，减少交接手续的同时提高了效率。当然还可将连续式、平行式流程改为同步流程，通过互动，不仅缩短了周期，还能在各作业的交流过程中相互调整及时发现问题，避免因缺少沟通导致无法挽救的问题的发生，这样提高了效率，减少了浪费。
因此，企业应根据自身具体问题，创造性地寻找适合自身的策略。但不管是什么策略，有一点是相同的，那就是要加强供应链流程网络的总体规划，使流程彼此协调，降低内耗。
4.3 技术架构。
信息系统集成涉及不同硬件、网络、操作系统平台、应用系统、数据基础和业务流程等许多方面的内容。在技术构架方面比较流行的解决方案有基于中间件的集成和基于Web services的集成。其中，中间件是提供通用接口，所有集成应用可用这个接口相互传递消息，接口起到提供一个应用程序协调的作用。每个接口定义了一个由另一个应用程序提供的商业过程。这种基于中间件的集成方案更易于支持众多的集成应用，并且只需要较少的维护。另外，中间件能够执行复杂的操作—交换、聚集、路由、分离和转换消息。而Web services提供了一种分布式的计算技术，用于在Internet或者Intranet上通过使用标准的XML协议和信息格式来展现商业应用服务。使用标准的XML协议使得Web service平台、语言和发布者能够相互独立网。基于Web services的应用集成，通过分析遗留应用，可以将需要暴露出来的功能另外封装成Web services，这样遗留应用既能被其它应用程序通过Web services进行调用，又能保证原有应用的运行不会受到影响。
5 结束语
由于供应链上各企业信息系统在建立之初并没有经过全面规划，且各企业是动态联盟，因此基于SCM的信息系统集成是一项系统工程，应在科学性、规范性的原则下进行。特别是面对信息系统之间的兼容性难题，需要企业在实施自己的信息系统时，尽可能充分考虑到今后的扩展性，尽量选用扩展性强、平台无关、数据格式标准化的信息系统，当然这只是针对还未实施即将实施信息系统的企业而言。大多数企业在构建自己的信息系统之时并未考虑到未来集成的需求。对于那些需要与其他企业实现信息系统集成而又没有留接口的企业，基于集成的需求所构造出的信息系统将会更大程度地满足跨企业信息系统集成需要，同时也需要企业在信息系统的更新和人员培训等各方面进行大量投资，从而为企业减轻因系统集成而带来的沉重经济负担。