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相应地，MRPII存在如下问题：
(1)提前期、批量等参数的预先静态设定
MRPII的提前期是推式计划的结果，需要提前设定，很可能造成与实际情况不符，另外，为了避免生产的波动，保持能力的平衡，MRPII不得不在提前期等指标上加大裕度，在制品库存大幅度增加。另外，批量不分加工批量和运转批量，且和系统的输入批量相等，影响订单的流动时间和提前期。
(2) 能力约束考虑不足
MRPII从MRP发展而来的，而MRP并未考虑能力约束问题，虽然MRPII加入了粗能力平衡 (Rough-cut Capacity Planning RCCP)和细能力平衡(Capacity Requirements Planning CRP)，但是并不能弥补其在能力平衡上的缺点，往往造成生产计划无法完成、物料需求不切实际等情况。
(3) 生产计划与控制相分离
MRPII制定计划时不考虑控制，而通过事后反馈进行生产控制相对于生产实际肯定存在着无法避免的滞后。另外，MRPII为每道工序都排计划，每道工序都严格按照既定的计划进行生产，而工序间又无协调机制，无法动态保证每道工序间的关联，造成工序间产量的不平衡、在制品库存增加以及需求与生产不一致等问题。
(4)底层功能较弱
生成计划时，一下全下，由于误差的累积，生成的作业计划很容易和实际脱节。其中，对那些生产能力已无法保证完成的产品，进行进一步地分解和计算已毫无意义。计划调整时，一改全改，问题由底向上层层反馈和所有计划从顶到底层层重排，造成生产计划的抗扰动能力差。另外，MRPII通常以周或天作为单位运行，即无法对每周或每天之内发生的变化做出迅速的响应，这对底层的决策与控制是一个很大的影响。而即便MRPII做到这种程度，也经不起实际情况的扰动。
1.2 基于JIT的计划管理与控制
JIT起源于日本，根植于重复性生产方式，强调需求牵引、相互合作以及消除浪费和减少成本，注重现场改善。