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二、目前会计核算中心运行的现状
近几年来，针对财政预算管理上存在着财政性资金收支管理不善、政府财政功能弱化等方面的问题，各地财政部门都进行了坚持不懈的探索和实践。比如，在收入管理上，取消了单位预算外资金收入户，实行集中财政专户统一管理，对行政事业性收费和罚没收入实行“收支两条线”管理;在支出管理方面，实行公用经费“内外统筹，核定指标，超支不补，节支留用”管理办法，推行部门预算、政府采购制度等办法，均取得了较好的效果，为会计核算中心的建立奠定了基础。
会计集中核算，一般是指在不改变单位内部理财机制、资金支配权和财务管理职能下，取消单位现有的银行账户，由财政部门统一在银行开设账户，集中办理资金支付结算、集中进行会计核算、集中管理会计档案和统一财务公开。
当前实行会计集中核算应遵循“三个不变”的原则：一是预算管理体制不变，年度经费预算仍由各单位编报，财政审核后批复给各单位，同时抄送会计核算中心;二是单位的理财机制不变，即资金的使用权和审批权仍在各单位;三是会计主体法律责任不变，即单位的各项收支仍由单位审批并承担相应的会计法律责任。实行会计集中核算，变化的主要有两个方面：一是由部门分散核算为集中核算，变“暗箱”操作为“阳光”操作;二是所有的经费集中管理，统一开户，由中心分户核算。
实行集中核算初期，各单位现行的内部财务管理制度维持不变，有利于单位继续保持理财的积极性，也有利于明确单位的权利和义务，使责权利相结合;集中核算，能提高财政资金使用的透明度，从而逐步形成管理规范、分配合理的运行机制。宿迁市宿城区于2002年7月成立了宿迁市宿城区会计核算中心，实行“单一帐户、集中支付、统一核算”的管理办法，统一办理资金结算，集中进行会计核算，集中会计档案管理，统一财务公开。截止2004年4月底，已有123家行政事业单位纳入会计核算中心实行集中统一会计核算。从一年多的运行情况来看，各方面工作运作较好，情况相对平稳，月报均按时报出，前后台之间、中心与银行之间、各分类帐和总帐之间的数据核对无误。在规范会计基础工作，提高会计信息质量，控制财政支出，制止铺张浪费等方面取得了显著成效。
三、当前实行会计集中核算主要存在的问题
实行会计集中核算后，预算单位的财务管理、财产管理、理财机制、年度预算收支计划的编报等都没有改变，但是会计核算职能和资金的管理权移至核算中心，在现有的条件下最大程度地约束了单位的支出行为。因此，在会计核算中心运作过程中，难免会出现不协调的地方。笔者认为，当前实行会计集中核算主要存在以下几个问题：
(一)缺乏规范的预算管理基础。实行会计集中核算，改变了单位分散管理财政性资金的现状，实现财政性资金的统一管理和集中收付，但是由于我国当前的预算管理制度还不健全，还没有建立一套科学的公共支出预算管理体系;同时，预算监督机制也很不健全，人大、审计等部门的监督职能还较薄弱，预算执行不力的矛盾相当突出。
实行集中统一核算，核算中心接受支付申请的依据是单位的预算指标，没有预算指标或超预算指标的支付申请，核算中心有权予以拒绝，从而起到强化预算约束的作用。所以，集中统一核算有赖于预算编制的相应改革，也就是说预算要细编，实行部门预算，支出预算要细化到每个部门及每个项目，对政府的的各项支出要按支出类别和性质编制专项支出项目库，核算中心根据细编的预算指标办理各项资金支付。而目前纳入核算中心管理的单位在实行部门预算规范化方面尚有差距，在支出方面随意性仍然存在，预算对支出的控制和约束非常薄弱。