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(三)开通远程报帐系统和远程查帐系统。会计核算中心要建立一个高效的运转机制，必须立足于电算化和网络化，用现代信息技术手段来处理日常工作。为了从根本上解决核算中心工作人员的超负荷工作量，笔者提出实现远程报帐的工作思路，经过分析得出，中心工作人员主要的工作量花在凭证的整理和摘要的输入上，实现远程报帐后工作人员只需花审核和修改的时间，从而大大地减少工作量，这样就可以有更多的精力从事单位的财务和预算管理工作。对单位而言，报销和凭证的输入工作可以在几天的时间里分散进行，到中心报帐时可以减少报帐等候时间，另外还可以根据自己单位工作的特点和需求设置一些明细科目，有利于对单位进行财务管理。整个管理流程完全自动化，单位、前台、后台之间数据资源完全共享，避免了重复劳动，从而大大地提高了工作效率。开通远程查帐系统，可以使单位及时了解单位预算执行情况、财务收支情况等，增进核算中心与单位之间的会计信息交流。
(四)明确经费开支标准、规范经费支出渠道。建议制定一套切实可行的经费支出标准，在各个单位统一执行，从而在制度上遏制各单位在费用支出上互相攀比、滥发钱物的现象。
(五)完善内外监控制度，确保财政资金、财产物资的安全。由于财政性资金集中管理后，财政资金管理的风险也大为集中，必须加强内控，建立内部制约机制，防范风险。每一笔支出都应实行事前审核，核对金额，在保证凭证真实、准确、合理、合法后，才能通知银行付款。要建立大额费用审批制度、超指标审批制度、超用款计划审批制度、大额借款审批制度以及预算单位的财产物资管理制度等内控制度，明确责任。同时，会计核算中心还要主动接受外部监督，向预算单位反馈资金支付的信息，与单位形成相互牵制的机制，接受财政内部监督部门、审计等职能部门的监督，保证财政资金、单位财产物资的安全。
实践证明，尽管目前实行会计集中核算还存在许多问题需要完善，但在加强财政资金收支管理、改变会计核算方式、预算执行情况控制等方面都已取得了成功的经验，我们应充分认识集中核算改革的重要性。当前的主要工作就是明确会计核算中心作为预算执行机构的地位，以预算执行为主要任务，转变工作职能，理顺内外关系，尽快从以财政国库集中收付制为主要形式的会计核算中心改革向规范的国库集中收付制过渡，随着我国公共财政的建立，国库集中收付制度的实施必须相应地成立国库支付执行机构(或国库支付中心或国库审结中心)，具体负责预算单位用款计划管理、财政直接支付的审核和支付、财政授权支付额度的下达、收入收缴管理、财政收支会计核算、信息系统的运行维护、收入收缴和支出业务的监督检查等工作。现在已实行会计集中核算的，只要将会计核算中心对单位会计核算的职能归还给单位，对会计核算中心的财政管理和监督职能进一步明确和细化，会计核算中心就可以直接转向国库集中支付的执行机构。