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最近，最新的冲突伤亡率普遍较低，这也促使一些观察员开始质疑：把这样资源密集型部署的医疗机构摆在首位有无必要。这种不确定性，伴随着为伤员的稳定和途中护理而制定的新的临床战略，以及诸如海上基地和船-目标的调遣等创新型的作战概念，给医疗部门在进一步降低各个紧急救助队的影响力方面提出了新的压力。
政府责任办公室和兰德公司已分别报道说，医疗机构传统的独立性一直是医疗卫生部门制定联合卫生保健措施最大的障碍。不过，纵观整个军事医学，还是有个别联合合作的例子，反映了在2020联合构想中所倡导的一体化的要求，如穿制服的医学科学院校、陆海空三军病理学研究所和国防医疗准备培训机构。这些联合机构里的医护人员是由三军组成的，资源也是由三军的医疗机构共同筹备或者由国防部提供。不过，大多数时候，陆海空三军都是继续经营他们自己的半独立的健康护理系统，并在现行结构下尽可能的去彼此合作，同时经营有点作为同行竞争对手不尽相同的战时准备和平时受益的使命。
作为对批评现状的回应，国防部已首次发放津贴，并在卫生部长下增加中央权力，控制实施福利措施的成本，并在履行战时筹备任务时所出现的问题做出了相应的反应。在当前资源和环境安全都面临威胁的情况下这种措施似乎是不够的。那么军事医疗系统又怎能达到像在联合构想2020中的那种预期的状态并在运作、组织、理念乃至技术方面做到充分的联合呢?答案就在于美国国防部目前采取的转型战略。
转型的建议
根据目前领导阶层来看， 军事医疗体系有许多领导人或者说一个真正的领导人也没有。军事医学界需要一个统一的医疗指挥系统来改变目前军事医疗部门和机构的面貌，从而使它从一个联邦自治的医疗部门转型为真正意义上的军事联合医疗机构。美国医务司令部(USMEDCOM) ，(新的组织有可能这样命名)，将是一个根据美国运输线和特种作战命令而调遣的一个功能性的战斗指挥部。指挥官将由一个四星级/首席医疗团队组成，对战时筹备以及平时福利任务的执行有着统一的问讯、责任和权力。
美国医务司令部在结构改组方面可以有多种方式，每一种在资源的有效利用和运作的灵活性上各有利弊。例如，在最近的一项对军事医疗系统重组的研究中，兰德公司的研究人员描述了三种可能的模式：一个是联合指挥中心与各医疗机构结合;另一个是联合指挥中心与战时准备部门以及三军医疗照护部门结合;还有一个是指挥中心和各医疗机构以及三军医疗照护机构相结合。
第一个方案，联合指挥与各医疗机构结合，反映了现行战斗指挥系统的组织结构，包括美国特种作战司令部。这种布局同目前的军事医疗系统类似，只是它可以向各个军事医疗部门的指挥官指派整体的任务。这种结构加强了军事医疗系统在组织和理论上的联合，但由于陆海空三军的医疗部门在思维上与其母公司是一致的，所以这种联合模式在技术和运作方面的影响不大。此外，卫生部长将继续通过三军医疗照护部门监督福利部门的运作。